ABCA9-AS1 (ABCA9 antisense RNA 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ABCA9-AS1
locus group:
non-coding RNA
location:
17q24.2
gene_family:
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None
alias name:
None
entrez id:
104355297
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ENSG00000231749
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uc060jgk.1
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NR_126414
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HGNC:39983
approved reserved:
2011-04-20

基因染色体位置

基因染色体位置

17q24.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

ABCA9-AS1是一个长链非编码RNA（lncRNA）基因，位于人类染色体17q24.2区域，属于ABCA基因家族的反义链转录本。ABCA基因家族是一组编码ATP结合盒（ABC）转运蛋白的基因，这些蛋白通常参与细胞内的物质转运，如脂质、胆固醇和代谢产物的跨膜运输。ABCA9-AS1作为ABCA9基因的反义RNA，可能通过调控ABCA9的表达或稳定性来影响其功能。目前关于ABCA9-AS1的具体生物学功能研究较少，但已知ABCA家族成员在脂质代谢、细胞膜稳定性和信号传导中起重要作用。ABCA9-AS1可能通过表观遗传调控或与RNA结合蛋白相互作用来调节ABCA9的表达，从而间接影响脂质代谢或胆固醇转运。若ABCA9-AS1表达异常（如过表达或降低表达），可能干扰ABCA9的正常功能，导致脂质代谢紊乱，进而与动脉粥样硬化、肥胖或神经系统疾病等病理过程相关。某些研究表明，ABCA基因家族的突变或表达失调可能与阿尔茨海默病、丹吉尔病等疾病有关，但ABCA9-AS1的直接关联仍需进一步验证。由于lncRNA通常具有组织特异性表达模式，ABCA9-AS1可能在特定组织（如肝脏或大脑）中发挥更显著的作用。未来研究需要深入探索其分子机制及与疾病的潜在联系。

None

无

OMIM数据库中对ABCA9-AS1基因的介绍     Wikipedia数据库中对ABCA9-AS1基因的介绍

基因序列

基因序列

ABCA9-AS1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ABCA9-AS1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1989446       rs4493129       rs4548939       rs4968828       rs4968984       rs7207125       rs7209358       rs7218871       rs7222838       rs7222904       rs8069698       rs8070357       rs9889750       rs9890027       rs9890816       rs9894350       rs9894880      

基因表达

基因表达

ABCA9-AS1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCACTACAACCTCTGCTTCC
60
GCAGCACAGTCTTATCTAATCC
59
TAACTTGTAAGAGCCCAGCA
59
GGGAGGTAAATCATTGACTCAC
59
CCTCTCAACAGATACAAGTCAC
59
CTTCTTCTGGATACCGATGG
58
TTTGGTTCACTGCAACCTG
59
AGGATGTACCACTGTAATCCC
59
CGGTATCCAGAAGAAGGTG
57
GTCCTAGTTGCATGTTCCA
58
TTGTTTCGTGGAAGGAAGAC
59
TGAGGTGTTTAAACTGATGGG
58
GGTTAGAACATCTATCAAGATCCC
59
CACATAGGTAGTTTCCTAAGAGTG
59
CAAAGACCTCAGAGTTTCCAG
59
AATCCACAAGGCAGAACAC
58
CACTACAACCTCTGCTTCC
58
CTCTCATTGGTCCTTATCTAATCC
58
GGATTAGATAAGACTGTGCTGC
59
GACTTCCTTGTTGAGAATGCC
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

ABCA9-AS1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ABCA9-AS1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ABCA9-AS1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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