AATF (apoptosis antagonizing transcription factor)

symbol:
AATF
locus group:
protein-coding gene
location:
17q12
gene_family:
alias symbol:
DED|CHE-1|CHE1|BFR2
alias name:
None
entrez id:
26574
ensembl gene id:
ENSG00000275700
ucsc gene id:
uc002hni.3
refseq accession:
NM_012138
hgnc_id:
HGNC:19235
approved reserved:
2002-09-13
17q12
基因染色体位置图

AATF(Apoptosis Antagonizing Transcription Factor)是一种抗凋亡转录因子,主要参与调控细胞周期、凋亡和DNA损伤修复等关键生物学过程。它通过结合特定DNA序列激活或抑制下游靶基因的表达,从而影响细胞的存活和增殖。AATF在多种组织中广泛表达,尤其在增殖活跃的细胞中表达较高。其蛋白结构包含多个功能域,如核定位信号和转录调控域,使其能够穿梭于细胞核与细胞质之间发挥作用。AATF的主要作用位点包括细胞核内的转录复合物以及参与应激反应的信号通路(如p53和NF-κB通路)。当AATF发生突变时,可能导致其抗凋亡功能丧失或异常激活,进而引发细胞凋亡失调或异常增殖,与多种癌症(如神经母细胞瘤、乳腺癌)和神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)相关。AATF过表达会增强细胞存活能力,抑制凋亡并促进肿瘤发生,同时可能干扰正常细胞周期调控;而降低表达则会导致细胞对凋亡信号敏感,增加基因组不稳定性。AATF属于Che-1基因家族,该家族成员均具有转录调控功能,并参与应激反应和细胞周期检查点的调控。家族共性包括含有保守的蛋白互作结构域和参与DNA损伤应答的能力。AATF还与其他基因(如p53、RB1)相互作用,共同维持基因组稳定性。在疾病治疗中,AATF可能成为靶向凋亡通路或癌症治疗的潜在分子靶点。

The protein encoded by this gene was identified on the basis of its interaction with MAP3K12/DLK, a protein kinase known to be involved in the induction of cell apoptosis. This gene product contains a leucine zipper, which is a characteristic motif of transcription factors, and was shown to exhibit strong transactivation activity when fused to Gal4 DNA binding domain. Overexpression of this gene interfered with MAP3K12 induced apoptosis. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质被鉴定与MAP3K12 / DLK,已知参与细胞凋亡的诱导的蛋白激酶相互作用的基础上。该基因产物含有亮氨酸拉链,它是转录因子的特征基序,并示出当融合到Gal4的DNA结合结构域,以表现出强转录活性。这个基因的过表达干扰MAP3K12诱导细胞凋亡。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

AATF基因的碱基序列:[NCBI]
Loading Gene Browser...
AATF基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs730003       rs730003       rs756449       rs756449       rs873950       rs873950       rs873951       rs873951       rs972518       rs972518       rs1001814       rs1001814       rs1045056       rs1045056       rs1266179       rs1266179       rs1564796      

AATF基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTTGCAATCCAGAAGTTACG
57
AGTTCTGTCCGAAGTTTCC
57
TGCTAATGCTCATCTGAAGGA
59
ATGAGTTCTCGAAGGAGCTG
59
GATCGTCTGATGAGGAAATATCTG
59
TCATCATATTCCTCCAGACCC
59
ACCGAAGTATCCGTGTGAC
60
CCAGACCAAATGCAAACCC
60
TGGGTTTCAGCATTTCACTC
59
CAGTTCTGTCCACTGAGCA
60
CTTGCAATCCAGAAGTTACG
57
AGTTCTGTCCGAAGTTTCC
57
CATGTCCTTAGCAAGCTACTG
59
CGGTACAGTTCTGTCCTGG
60
AGGTCTTCAGGAAGAGTTGC
60
AAATCTCCTCACTTCCCGC
60
TAATACTTGCTCGGAGACCA
58
CAGTTCTGTCCCACAAAGAC
59
TATCGAGTTCTTGGCAAACCT
60
CTTGAGGAAGGATCTCCGG
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
AATF
BAX
Repression
AATF
CDKN1A
Unknown
AATF
KLK3
Unknown
AATF
MYC
Activation
AATF
TP53
Unknown

AATF基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

AATF基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005634
A0A087WTH8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
A0A087WWS8 (UniProtKB)
IEA
GO:0003700
Q9NY61 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q9NY61 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NY61 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NY61 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NY61 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NY61 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NY61 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NY61 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NY61 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q9NY61 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q9NY61 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q9NY61 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q9NY61 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q9NY61 (UniProtKB)
IDA
GO:0005730
Q9NY61 (UniProtKB)
IBA
GO:0005730
Q9NY61 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q9NY61 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q9NY61 (UniProtKB)
IDA
GO:0005794
Q9NY61 (UniProtKB)
IEA
GO:0005813
Q9NY61 (UniProtKB)
IDA
GO:0005925
Q9NY61 (UniProtKB)
IDA
GO:0006974
Q9NY61 (UniProtKB)
IEP
GO:0007155
Q9NY61 (UniProtKB)
IEA
GO:0007346
Q9NY61 (UniProtKB)
IEA
GO:0032929
Q9NY61 (UniProtKB)
IDA
GO:0040016
Q9NY61 (UniProtKB)
IEA
GO:0042254
Q9NY61 (UniProtKB)
IEA
GO:0042985
Q9NY61 (UniProtKB)
IEA
GO:0043066
Q9NY61 (UniProtKB)
IMP
GO:0043522
Q9NY61 (UniProtKB)
IPI
GO:0043522
Q9NY61 (UniProtKB)
IPI
GO:0044822
Q9NY61 (UniProtKB)
IDA
GO:0044822
Q9NY61 (UniProtKB)
IDA
GO:0045944
Q9NY61 (UniProtKB)
IDA
GO:0048156
Q9NY61 (UniProtKB)
IEA
GO:2000378
Q9NY61 (UniProtKB)
IDA

可能调控 AATF基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of breast 0.002638474 1 0 BeFree_GAD
Obesity 0.002367032 1 0 GAD
Leukemia, Lymphocytic, Acute, L1 0.000271442 1 0 BeFree
Neuroblastoma 0.000271442 1 0 BeFree
Chronic Lymphocytic Leukemia 0.000271442 1 0 BeFree
leukemia 0.000271442 1 0 BeFree
Endometrial Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Colon Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Bronchogenic Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号,实时查看信息,关注医学生物学动态。