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　　荷兰内梅亨大学医学中心的一个研究小组对数千个de novo突变进行荟萃分析，鉴定出10个智力残疾的候选基因，这些突变是从两千多个患病家庭的外显子组序列中鉴定出的。

       在这项研究中，研究人员对820名患有轻度至重度智力残疾的儿童及其父母进行外显子组测序，随后综合了已发表研究中其他1,300个家庭的序列信息。当他们分析这些家庭中的2,637个de novo突变时，他们发现10个基因与智力残疾相关。

研究小组以820名患病儿童及其父母为研究对象，利用安捷伦的SureSelect技术富集了基因组的蛋白编码区域，并利用Illumina的HiSeq仪器进行测序。

       在平均覆盖深度达75倍的外显子组中，研究人员发现了1,083个可疑的de novo突变，影响到915个基因。考虑到基因特异的突变率，他们发现18个已知的智力残疾基因，似乎不成比例地受到de novo突变的影响。

       为了梳理出新的候选基因，研究小组剔除了已知基因中含有突变的个体，并重复分析，将频繁发生的de novo突变缩小到4个基因上：DLG4、PPM1D、SOX5和TCF20。此外，研究人员利用已发表研究中的数据，发现了另外6个候选基因。

       在荟萃分析中，研究人员对1,471名个体中的1,235个基因进行分析，发现除了上面的4个基因之外，还有6个基因：RAC1、SMAD6、SON、TLK2、TRIP12和SYNCRIP，它们也包含许多功能丧失的de novo突变。

       研究小组指出，一些基因中的de novo突变似乎产生了重叠的临床特征，包括两名儿童中TLK2基因的突变带来了相似的面部畸形。新分析中受到de novo突变影响的许多基因或通路与其他疾病的关联基因重叠，包括自闭症谱系障碍或其他神经发育疾病。

   “我们的研究强调了de novo突变对各种神经发育表型的影响，”内梅亨大学医学中心的人类遗传学研究人员Christian Gilissen及其同事写道，并指出“大量的罕见发育障碍基因仍有待确定”。

      小编在基因云馆中也发现了关于DLG4的信息：

      DLG4基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：细胞质、细胞膜、液泡、内质网、细胞骨架。

    可能调控DLG4基因的相关microRNA：    hsa-miR-375、hsa-miR-125a-3p、hsa-miR-125a-5p 等。

       点击这里查看关于DLG4基因的详细信息。

       小编在基因云馆中也发现了PPM1D、SOX5、TCF20、SMAD6、SON、TLK2、TRIP12和SYNCRIP 的信息。

       点击这里查看。

原文检索

Meta-analysis of 2,104 trios provides support for 10 new genes for intellectual disability

Nature Neuroscience (2016) doi:10.1038/nn.4352

Metaanalysis of 2104 trios provides support for 10 new genes for intellectual disabilityNatureNeuroscience.pdf