基因云馆新一代信息数据库

摘　要：

       利用基因芯片技术研究肺腺癌、转移淋巴结、癌旁正常及胚胎肺组织中的基因表达差异,并利用代谢通 路数据库分析这些基因与代谢通路相关性信息。

         肺腺癌 （ lung adenocarcinoma ）是肺癌的 一种，属于非小细胞癌 。不同于 鳞状细胞肺癌 ，肺腺癌较容易发生于女性及不抽烟者。起源于支气管粘膜上皮，少数起源于大支气管的粘液腺。发病率比鳞癌和未分化癌低，发病年龄较小，女性相对多见。多数 腺癌起源于较小的支气管，为周围型肺癌。早期一般没有明显的临床症状，往往在胸部 X 线检查时被发现。表现为圆形或椭圆形肿块，一般生长较慢，但有时早期即发生血行转移。淋巴转移则发生较晚。

       淋巴结转移是肿瘤最常见的转移方式，是指浸润的肿瘤细胞穿过淋巴管壁，脱落后随淋巴液被带到汇流区淋巴结，并且以此为中心生长出同样肿瘤的现象。

       分别抽取肺腺癌、转移淋巴结、癌旁正常和胚胎肺组织的总RNA并纯化mRNA,用逆转录的方法,将各 mRNA的两种荧光Cy5和Cy3标记的cDNA链做探针,并与含有1152条人类全长基因芯片上进行杂交。

       用计算机处理和分析。将实验所得基因映射到 （Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）通路数据库的基因表达调控通路上,检测同一基因表达调控通路内基因的共表达趋势。

        4例肺腺癌组织和癌旁正常组织比较共表达 差异基因25个;3例肺腺癌组织和转移淋巴结组织比较共表达差异基因8个;1例胚胎肺组织和癌旁正常组织比较差异表达基因316个,且与肺腺癌组织和癌旁 正常组织比较16个基因有共同表达差异。

       在β-丙氨酸代谢通路和丁酸代谢通路中的基因与疾病组织中的基因显著相关（P〈0.05）,而与癌旁组织和淋巴结 组织中的基因无关（P〉0.05）。

       结论肺腺癌组织与癌旁正常组织比较、肺腺癌组织和转移淋巴结组织比较均存在共表达差异基因,这些基因可能与肺腺癌的发 生、发展有关。

      代谢通路分析结果提示,在β-丙氨酸代谢通路和丁酸代谢通路中存在着肺腺癌疾病相关的基因,且在同一通路中的基因有共表达趋势。

     通过这一研究对肺腺癌、转移淋巴结、癌旁正常及胚胎肺组织中的基因表达差异优劣有了新的认识，对以后肺腺癌的治疗奠定了基础。