基因云馆新一代信息数据库

预处理

预处理就是将基因表达的芯片探针或者测序获得的基因片段，进行各种处理，最终获得基因相对表达值的过程。

准备数据

你必须有一个基因表达数据制作的 RData文件。 示例文件: Demo.RData。

如果没有，你可以先搜索一下在我们的数据库中是否有您需要的数据。你可以使用我们的数据库进行查询和分析。 

将准备的eSet数据中的基因表达数据进行预处理；消除实验中的噪点数据以及去除基因几乎没有变化的管家基因等。

• 在Genelibs 窗口中打开模块

注意事项

• 预处理数据是对数据进行一系列的标准操作，通常包含一个或多个数据预处理方法(按此顺序):

1. 数据过滤：设置基因表达值的上限和下限的阈值。任何价值低/高于阈值上限值重置为阈值/上限值

2. 填补缺失的数据以及对数据进行描述：对原始数进行一定的作图分析，确定数据质量和大致的

3. 数据的转换：差异范围将基因的表达值转换为log2值，删除表达过低或者过高、以及变化过小数据

4. 数据的归一化：调整由于基因芯片技术引起的误差

支持芯片:

illnmina系列/affy系列/甲基化芯片等多种；如果芯片平台不在列表中，而数据又来自于平台中的“GEO数据库检索”模块的结果，你可以试一试使用platform列表里的“unkown just try it”选项，但不能保证一定可以出结果。