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探讨膜性肾病(MN)差 异性表达microRNA的靶基因

来源/作者:Genelibs   发表时间:June 17, 2016, 9:51 a.m.   文章热度:1311   


摘要

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探讨膜性肾病(MN)差 异性表达microRNA的靶基因主要参与的Gene Ontology(GO)富集与Kyoto Encyclopedia Genes And Genomes(KEGG)通路.

       膜性肾病是一个病理形态学诊断名词,是导致成人肾病综合征的一个常见病因,其特征性的病理学改变是肾小球毛细血管袢上皮侧可见大量免疫复合物沉积。临床表现为肾病综合征(大量蛋白尿、低蛋白血症、高度水肿、高脂血症),或无症状、非肾病范围的蛋白尿。

      100例MN患者与100例健康对照者(NC)作为实验对象.100例NC随机分成10组(NC1~10),每组 10人.同样100例MN随机分成10组,每组10人(MN1~10).分别从实验参与者静脉采取全血10 mL,来源于静脉血的单个核细胞用于提取RNA.

      总RNA以组为单位等量混合用于高通量技术测序(high-throughput sequencing),对RNA测序结果进行长度分布,基因比对,RNA分类注释,RNA特有序列及其公共序列分析后,获得小核糖核酸 (microRNA)进行MN与NC差异性表达分析来寻找显著表达microRNA.

      应用相关的软件对差异性表达的microRNA进行靶基因预测,靶基 因借助功能注释软件对其参与的生物过程进行GO富集及KEGG通路分析.

      靶基因在GO富集分析中主要集中在细胞器官组成,细胞膜组成,离子结合,生 物代谢过程,生物调节过程等.靶基因在KEGG通路分析中主要参与嘌呤代谢通路,代谢产物生物合成,癌症通路,蛋白激酶信号通路等.

      MN与NC之间 存在着显著差异性表达microRNA.差异性表达的microRNA的靶基因参与的GO富集与KEGG通路可能与MN的发病机制与临床症状有着密切的联 系.这一结果为以后更详细研究膜性肾病奠定了基础。

 


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